空之境界 上
這是一個發生在夏末，少女們不斷飛落跳下相繼自殺的故事。少女們，毫無征兆突發性的從廢墟大樓的屋頂上跳向天空，隨后落下。等待她們的只有死。
這些女孩在學校也并無異常，相互間也并非朋友關系。這些一切毫無關聯性，連自殺的理由都找不到，完全無法解釋的自殺事件逐一被不斷報道。但是唯一只有一個人看出了這事件其中的關聯性。這個人就是最高位的人偶師、也是一位沒有成為魔法使的魔術師 —— 蒼崎澄子。而搜索調查這個連續自殺事件的人就是擁有能看見事間萬物之死線能力“直死之魔眼”的兩儀式。她用她的眼睛捕捉到了在虛空中飛舞的少女們的幽靈，而這些幽靈到底又在想什么呢？是到達相同道路同胞們的哀憐，還是同族的嫌惡，或許是來自威脅某種重要存在之人的敵意？在那個發生慘案的現場等著她的是誰都不知道的，展開著重重包圍圈套的序章。
空之境界 中
這是還在高中生的時候，16歲的兩儀式與黑桐干也相逢的故事。一直都不想和他人扯上任何關系的式吸引了干也的注意，并想和式之間產生某種關聯。當時并未注意到這就是戀情。不久之后他們開始一點點擁有共同的空間，而那時他的日子的確過的十分安穩。
——直到街上出現了連續獵奇的殺人事件。
有一天，干也與一個名叫織的，存在于式身體中另一個人格相遇了。肯定的式與否定的織。相反，卻擁有同樣思考方式與嗜好的兩個式，對于干也來說漸漸變的越來越混亂。如此，在干也的胸中就產生一個預感。每夜，不斷進行著獵奇殺人事件的人是誰？當然預感只是預感而不是事實，若不是自己親眼看到其殺人身姿的話是無法相信的，為了確認這個預感，他暗暗的下了決心.去兩儀家獲得一些蛛絲馬跡的條件、不為人所知的“式們”的關系、在血泊中站立的少女,在不知不覺中已經開始引導了式與干也命運的軌跡。
空之境界 下
那個男人經歷了悠久的時間，作為萬物的靈長對人類的營生感到絕望，為了看到那個臨終，開始渴望著，渴望著，渴望著，渴望著萬物的開始與終焉之“根源”。
此男人名曰荒耶宗蓮。過去，有一位與他截然不同的異國學者是他的競敵，其名曰蒼崎橙子——一位獲得三原色中赤紅之稱號的魔術師，接受封印指定的最高位人偶師。
總有一天會在某處相會是他們的宿命。這一場所，之所以會很諷刺地建造在與他自己也有關聯的“螺旋之地”，同時也是橙子所居住的城市里，是因為受了妨礙一切試圖到達根源之存在的“抑止力”的影響。抑止力，其一是作為靈長的人類為了能在吾世繼續生存，是任意無愿望無意識的集合體。其二是人的構造活動等，在這地球上生活延續下去的生存本能。結果，無論其中哪一點在起作用，引起了不可解的事件。他們的遭遇，是偶然還是必然，，誰都不知道，但道路的去向卻漸漸顯示，于是個人各自開始前進。
空之境界 未來福音
黑桐干也遇見擁有未來視能力的少女，瀨尾靜音；兩儀式遇見同樣擁有未來視能力的連續炸彈魔，倉密目留科。雙方的“未來”彼此疊合，將迎向什么樣的結局？連接未來與過去的空白（Bonus Track）──獻給未來的福音，通通都在這一本！