故事描述的是 個有關“ 二次沖擊”的記事。公元2000年有顆巨大的隕石墜落在南極冰山附近（政府宣稱），
高溫造成部分冰塊溶化，連帶使得全球水位上漲，接下來的天災人禍更是連綿不斷，公元2015年又出現了新的入侵者，
種似人的巨大機械戰斗群，人們將之稱為”使徒”，大概是影射他們是上帝派來的使者，要來消滅作惡多端的人類吧。
人類此刻的各種軍事武器對使徒可說是毫無用處，為此，當時地球的政治中心決定重用NERV這個組織，
他們以zui精密的技術，花費巨資研究出 種以駕駛員的神經直接控制的”泛用人形決戰兵器”，
這種高科技產物將駕駛員與機器做了精細的契合，籍由意志及身體的反映來控制EVA。
不過由于當時這些技術還在研發階段，所以有許多障礙還無法立即克服。而且因為并不是每個人都能自由的駕駛EVA。
駕駛人選 直是NERVzui頭疼的地方，除了符合條件的人難覓，而且還 須經過幾個月訓練才能和EVA達到同步活動的基本能力。
而后，在世界上發現了3名可以駕駛EVA的少男少女，人們把希望都寄托在了他們身上。
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