《吳子建印存》一冊裝，分紅、藍兩種版本，紅裝本附函套吳子建先生原拓鳥蟲印印花并編號（書中內容相同）。 16開，計268頁，輯吳子建先生于四十多年間（1963~2007）所創作的篆刻精品，除去放大部分不計，輯印二百余方。
全書分五個章節：
一、含苞欲放 本章為吳子建先生自藏印，沈尹默先生題寫扉頁，精選此譜中4頁，計24方印作。
二、春蘭吐芳 本章為吳子建先生于1960~1970年間所作篆刻精品，計44方印作。此章手繪烏絲欄部分乃高式熊先生取吳大澂所遺印譜紙親手拓成。
三、采菊東籬 本章為吳天祥先生數十年悉心收集，粘貼成冊，共計97方印作，其中有“榕城將軍章”組印，及鳥蟲印精品頗多，并附印面墨拓。
四、問梅消息 本章亦為剪貼本，計51印，乃吳子建先生幾十年來為其友陳梅璋先生所刻之印。
五、精選萃編 本章計61頁，和秋水齋金石叢刊的其他書目一樣，原則上是16倍等比例放大，個別印章、邊款16倍放大后超出頁面，適當縮小。
從中我們可以看到吳子建先生在篆刻創作上的心路歷程，例如運用將軍印的線條在鳥蟲印中進行創作，可謂吳子建先生的一大創舉，也深深影響著后學者的鳥蟲印篆刻創作。
